1. fejezet - 8. Régmúlt és jelen keresztútján: A toolkit gének felfedezése

Tartalom

8.1 Fejlődési mintázatképzés (pattern formation)
8.1.1 KOMPARTMENTEK, a fejlődés moduljai
8.2 A toolkit és az állatok testfelépítése
8.2.1 Génszabályozás és testfelépítés
8.2.2 A genetikai szabályozás hierarchikus felépítésű
8.3 Áttörés a fejlődésbiológiában — A Drosophila korai fejlődésének analízise
8.4 Áttörés az evolúciós kutatás felé - Hox-gének és a modern EVO-DEVO hajnala
8.5 A genetikai „toolkit” - együtt a testterv kialakításáért felelős gének
8.5.1 A toolkit génjeinek jellemzői
8.5.2 A toolkit mindenhatósága
8.6 A homológia fogalmának folyamatos evolúciója
8.7 Mit fogadunk el bizonyítéknak az EVO-DEVO-ban?
8.8 Morfológiai evolúció és génszabályozás
8.8.1 A toolkit evolúciója
8.8.2 Tandem kapcsolt, rokon génklaszterek kiterjedése/expanziója
8.8.3 Mégsem csak duplikáció…- A szabályozás evolúciójának elsőbbsége a génkifejeződés finomszabályozásában
8.8.4 A cisz-regulátor DNS funkciója és evolúciója
8.9 A toolkit kialakulása: az első állatok
8.9.1 ParaHox komplex, Hox, gének funkcióváltozásai
8.9.2 A toolkit expanziója és a morfológiai komplexitás evolúciója
8.10 Közös ősünk - az Urbilateria rekonstrukciója
8.10.1 Párhuzamok a rovarok és gerincesek idegrendszerének korai fejlődésében
8.10.2 A Cnidariák és lárváik, mind PDA jelöltek
8.11 A testtervek és a testrészek diverzifikációja
8.11.1 Az Ubx génexpresszió anteriorális határának eltolódása ízeltlábúakban
8.11.2 Hox gének expressziós mintázata gyűrűsférgekben
8.11.3 A tetrapodák axiális szerveződésének különbségei, az állatok Hox-expressziós doménjeinek eltolódásában mutatkozik meg.
8.12 A Hox fehérjék és az általuk szabályozott gének
8.12.1 Ízelt lábak és azok hiánya. A végtagnélküli rovarpotroh kifejlődése
8.12.2 A szárnyas rovarok evolúciója
8.13 A négylábúak eredete
8.14 Hox-gének: descent with modification

A toolkit-génkészletnek, ill. annak elemeinek felfedezése kétségtelenül a biológia legnagyobb horderejű és legszélesebb horizontokat nyitó, új paradigmákat hozó fejezetei közé tartozik. A történeti hűséghez hozzátartozik, hogy számos nagy felfedezés időben párhuzamosan történt, és hogy a kép természetesen fokozatosan, de utólag tekintve gyorsan és lenyűgöző hatékonysággal tisztult le.

A felfedezések döntő része nem kimondottan evolúciós szemszögből történt, de a kép teljességéhez hozzátartoznak ezek az eredmények is. A fejezetben áttekintjük azokat a fejlődésbiológiai eredményeket is, amelyek fontosak a „toolkit”-koncepció nagyszerűségének megértéséhez, vállalva, hogy a teljességre itt reményünk sincsen. Az érdeklődők a következő fogalmakról teljesebb képet alkothatnak fejlődésbiológia tárgyú könyvek tanulmányozásával.

8.1 Fejlődési mintázatképzés (pattern formation)

A fejlődésbiológia célja annak a folyamatnak a megértése, melynek során a petéből felnőtt egyed alakul ki.

Mai értelmezés szerint tulajdonképpen a fejlődésnek minden tér- és időbeli valamint minőségváltozással kapcsolatos vonatkozása a fejlődési mintázatképzés (pattern formation) tárgykörbe tartozik.

Szűkebb értelemben e folyamat során alakul ki a majdan differenciálódó sejtek elrendeződése az élőlényben, előrevetítve a celluláris differenciáció térbeliségét.

A „testterv” (Bauplan, body plan) a biológia egyik legnehezebb fogalma, itt csak intuitív megközelítésére vállalkozunk:

Egyes nagyobb élőlénycsoportok – „monofiletikus taxonok” – testének részei mindig meghatározott módon rendeződnek el, függetlenül a környezettől. Ez az elrendeződés a testterv.

A testterv kialakulásának így mindenképpen örökletes alapjai vannak, tehát érdemes genetikai módszerekkel tanulmányozni. 1. ábra

1.1. ábra - A puhatestűek testterve

A puhatestűek testterve


A fejlődési mintázatképzés néven összefoglalt folyamatok felelősek az összetett forma kialakulásáért, és a test­terv fejlődési programjának kivitelezéséért.

A fejlődési mintázatképzés kulcsfogalma a POZICIONÁLIS INFORMÁCIÓ.

Van egy olyan sejtparaméter, a POZICIONÁLIS ÉRTÉK, amely hozzárendelhető a fejlődő rendszerben az adott sejt pozíciójához. Értelmezéséhez mindig szükség van egy viszonyítási alapra („koordináta rendszerre” vagy inkább egy határvonalra, „boundary-re”), amelyhez a sejtek pozíciójukat viszonyítják. Genetikai állományuk közvetlenül nem tartalmaz olyan információkat, amelyek lokalizációjukat „közölnék” a sejtekkel 2. ábra.

1.2. ábra - A csirkeszárny és a légy szárnya egyaránt pozicionális jelet használ mintázata kialakításakor. A pozicionális jel egy morfogén, amely az A/P tengely mentén hat. A csirkénél a jel a polarizáló régióból indul, míg a légynél a jel forrása a kompartmenthatár; a jelet a sejtek másképpen értelmezik az elülső-és hátsó kompartmentben

A csirkeszárny és a légy szárnya egyaránt pozicionális jelet használ mintázata kialakításakor. A pozicionális jel egy morfogén, amely az A/P tengely mentén hat. A csirkénél a jel a polarizáló régióból indul, míg a légynél a jel forrása a kompartmenthatár; a jelet a sejtek másképpen értelmezik az elülső-és hátsó kompartmentben


A pozícionális információ egyik vonzó tulajdonsága általános felhasználhatósága. Ugyanaz a koordinátarendszer és ugyanaz a szignál többször is felhasználható, akár ugyanabban az embrióban. Az emlősök elülső és hátulsó végtagjaiban és a legyek szárnyában hasonló módon molekuláris szignálok határozzák meg a pozícionális információt (az A/P azaz anterio-poszteriorális és D/V azaz dorzoventrális viszonyokat)

A pozicionális információnak másik alapvető sajátsága az, hogy független attól, hogy a sejtek miként differenciálódnak, vagyis nincsen rokonság a pozicionális érték és a differenciáció módja között. A sejtek tehát pozicionális információjukat fejlődési útjuknak és genotípusuknak (epigeno­típusuknak) megfelelően értelmezhetik. A pozicionális értékek azonosak pl. a rovarok lábában és csápjában, mint azt a későbbiekben látni fogjuk, de interpretációjuk másként történik.3. ábra, 4. ábra

1.3. ábra - Megfelelés a csáp és a láb részei között. Az Antennapedia mutánsban a csáp bizonyos régiói lábstruktúrákká transzformálódtak. A nyilak a csáp régióit mutatják, amelyek csakis a láb nekik megfelelő struktúráivá transzformálódtak. Hasonló megfelelés volt tapasztalható a génkifejeződés szintjén is

Megfelelés a csáp és a láb részei között. Az Antennapedia mutánsban a csáp bizonyos régiói lábstruktúrákká transzformálódtak. A nyilak a csáp régióit mutatják, amelyek csakis a láb nekik megfelelő struktúráivá transzformálódtak. Hasonló megfelelés volt tapasztalható a génkifejeződés szintjén is


1.4. ábra - A proximális láb-bimbó sejteket a szárny-bimbó disztális részébe ültetve azok a progresszív zónában disztálisabb pozícionális értéket nyernek az eredetinél, és karmos ujjakat alakítanak ki comb helyett.

A proximális láb-bimbó sejteket a szárny-bimbó disztális részébe ültetve azok a progresszív zónában disztálisabb pozícionális értéket nyernek az eredetinél, és karmos ujjakat alakítanak ki comb helyett.


Mintázatkialakítás és determináció. Klasszikus kísérleteken alapuló hipotetikus séma. A fejlődés első szakaszában a specifikáció és elköteleződés (commitment) a citoplazmatikus determinánsok révén történik. A citoplazmatikus determinánsok térben a pete belső mintázatképzési folyamata, az ooplazmás szegregáció folyamán rendeződnek. Egy részük morfogénként működik, és a pólusokon lokalizálódik, megteremtve a morfogéngrádiens-képzés lehetőségét. A morfogének különböző koncentrációi különféle elsődleges zigótikusan aktív regulátorgéneket aktiválnak és az embriót néhány széles doménre osztják. A másodlagos szabályozógének kifejeződési doménjei az embriót felosztják még finomabb doménokra, különféle sejtsorsokkal. A sejtidentitási gének aktiválása és aktivitásuk fenntartása lehetővé teszi a sejteknek, hogy sorsukat fenntartsák fejlődésük további részében.A hasadások folyamán más-más blasztomerekbe más-más determinánsok jutnak. A későbbi fejlődés folyamán mintázatképzési-és determinációs folyamatok (amelyek nem választhatók el) a különböző sejtek közötti jelcserén alapulnak. 5. ábra

1.5. ábra - Mintázatkialakítás és determináció

Mintázatkialakítás és determináció


8.1.1 KOMPARTMENTEK, a fejlődés moduljai

A KOMPARTMENTALIZÁCIÓ olyan határok létét jelenti az élőlényen belül, amelyeket bizonyos sejtek utódjai (klónjai) sohasem lépnek át. A határok a legtöbb esetben nem köthetők anatómiai értelemben vett határvonalakhoz. A határok kulcsjelentőségűek, amennyiben a kompartmenthatárokból kiinduló jelek alakítják ki a kompartmentek egyes sejtjeinek pozicionális értékét. A kompartmentek sejtjei kisszámú „ALAPÍTÓ” (FOUNDER) sejttől származnak. A sejtklónok mozgásának korlátozódása az elemzett esetekben sejtjeik felszínének sajátságaira vezethetők vissza.